Bio Informatika

Pendahuluan

Bioinformatika atau Bioinformatics adalah ilmu yang mempelajari tentang penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup ilmu matematika, statistik, dan komputer untuk memecahkan masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Secara esensial, bioinformatika mempunyai tiga komponen :

1. Penciptaan database yang memungkinkan penyimpanan dan manajemen pengaturan biologis yang besar.
2. Penembangan algoritma dan statistik untuk menentukan hubungan diantara sejumlah data set yang besar.
3. Penggunaan dari perkakas untuk analisa dan penafsiran dari berbagai jenis data biologis, mencakup DNA, RNA, dan urutan protein, profil ekspresi gen dan jalur biokimia.

Kemampuan untuk memahami dan memanipulasi kode genetik DNA ini sangat didukung oleh teknologi informasi melalui perkembangan hardware dan soffware. Baik pihak pabrikan sofware dan harware maupun pihak ketiga dalam produksi perangkat lunak. Salah satu contohnya dapat dilihat pada upaya Celera Genomics, perusahaan bioteknologi Amerika Serikat yang melakukan pembacaan sekuen genom manusia yang secara maksimal memanfaatkan teknologi informasi sehingga bisa melakukan pekerjaannya dalam waktu yang singkat (hanya beberapa tahun).

Sejarah

Isitilah bioinformatika pertama kali dikemukakan pada pertengahan tahun 1980-an untuk mengacu pada penerapan komputer dalam biologi dan pada mulanya diartikan sebagai manajemen dan analisis DNA, RNA dan data sekuensing protein. Namun demikian, penerapan bidang-bidang dalam bioinformatika untuk analisis sekuensing telah dilakukan sejak tahun 1960-an, tetapi hal ini mempunyai kepentingan yang sempit sampai kemajuan dalam teknologi sekuensing yang mendorong ke arah suatu perkembangan yang cepat dalam jumlah sekuens yang tersimpan di database seperti GenBank.

Saat ini, istilah Bioinformatika telah meluas untuk menyertakan tipe data biologi yang berbeda, sebagai contoh struktur protein, profil ekspresi gen dan interaksi protein. Masing-masing dari tipe data tersebut memerlukan pengaturan database, algoritma dan metode statistik sendiri-sendiri. Penemuan teknik sekuensing DNA yang lebih cepat menjadi landasan terjadinya ledakan jumlah sekuens DNA yang berhasil diungkapkan pada 1980-an dan 1990-an, menjadi salah satu pembuka jalan bagi proyek-proyek pengungkapan genom, meningkatkan kebutuhan akan pengelolaan dan analisis sekuens, dan pada akhirnya menyebabkan lahirnya bioinformatika.

Sekuensing DNA satu organisme, misalnya suatu virus memiliki kurang lebih 5.000 nukleotida atau molekul DNA atau sekitar 11 gen, yang telah berhasil dibaca secara menyeluruh pada tahun 1977. Kemudia Sekuen seluruh DNA manusia terdiri dari 3 milyar nukleotida yang menyusun 100.000 gen dapat dipetakan dalam waktu 3 tahun, walaupun semua ini belum terlalu lengkap. Saat ini terdapat milyaran data nukleotida yang tersimpan dalam database DNA, GenBank di AS yang didirikan tahun 1982.

Masa depan bioinformatika adalah pengintegrasian data. Sebagai contoh, pengintegrasian sumber data yang sangat bervariasi seperti data klinis dan data genomik akan membantu kita dalam menentukan penggunaan gejala penyakit dalam memprediksi mutasi genetik dan sebaliknya. Pengintegrasian data sistem informasi geografi (SIG) seperti peta, sistem cuaca, dengan hasil kesehatan dan data genotipe, akan membantu kita untuk memprediksi hasil sukses dari penelitian agrikultural. Ruang lingkup masa depan penelitian bioinformatika adalah membandingkan secara skala besar dari genomik. Sebagai contoh, pengembangan perkakas yang dapat melaksanakan 10 jalur pembandingan genom akan mendorong majunya angka penemuan pada bidang bionformatika. Selama ini, modeling dan visualisasi jejaring (network) yang penuh dari sistem kompleks dapat digunakan untuk memprediksi bagaimana sistem (atau sel) bereaksi terhadap obat sebagai contohnya. Tantangan teknis yang melingkupi bioinformatika ditujukan pada komputer yang lebih cepat, kemajuan teknologi dalam kapasitas ruang penyimpanan dan peningkatan bandwidth. Akhirnya, pertanyaan kunci riset bagi masa depan bioinformatika adalah bagaimana secara komputasi membandingkan pengamatan biologi kompleks, seperti pola ekspresi gen dan jejaring protein. Bioinformatika adalah suatu sistem yang mengubah pengamatan biologi kepada suatu model yang komputer akan dapat memahaminya. Hal ini adalah tugas yang sangat menantang karena ilmu biologi dapat menjadi sangat kompleks. Permasalahan bagaimana untuk mendigitalisasikan data fenotif seperti perilaku, elektrokardiogram dan hasil kesehatan kepada bentuk yang dapat terbaca komputer menawarkan tantangan yang menarik di masa mendatang bagi para pakar bioinformatika.

PenerapanBiologis

Basis Data Sekuens Biologis

Sesuai dengan jenis informasi biologis yang disimpannya, basis data sekuens biologis dapat berupa basis data primer untuk menyimpan sekuens primer asam nukleat maupun protein, basis data sekunder untuk menyimpan motif sekuens protein, dan basis data struktur untuk menyimpan data struktur protein maupun asam nukleat.

Basis data utama untuk sekuens asam nukleat saat ini adalah GenBank (Amerika Serikat), EMBL (Eropa), dan DDBJ(Inggris) (DNA Data Bank of Japan, Jepang). Ketiga basis data tersebut bekerja sama dan bertukar data secara harian untuk menjaga keluasan cakupan masing-masing basis data. Sumber utama data sekuens asam nukleat adalah submisi langsung dari periset individual, proyek sekuensing genom, dan pendaftaran paten. Selain berisi sekuens asam nukleat, entri dalam basis data sekuens asam nukleat umumnya mengandung informasi tentang jenis asam nukleat (DNA atau RNA), nama organisme sumber asam nukleat tersebut, dan pustaka yang berkaitan dengan sekuens asam nukleat tersebut.

Sementara itu, contoh beberapa basis data penting yang menyimpan sekuens primer protein adalah PIR (Protein Information Resource, Amerika Serikat), Swiss-Prot (Eropa), dan TrEMBL (Eropa). Ketiga basis data tersebut telah digabungkan dalam UniProt (yang didanai terutama oleh Amerika Serikat). Entri dalam UniProt mengandung informasi tentang sekuens protein, nama organisme sumber protein, pustaka yang berkaitan, dan komentar yang umumnya berisi penjelasan mengenai fungsi protein tersebut.

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) merupakan perkakas bioinformatika yang berkaitan erat dengan penggunaan basis data sekuens biologis. Penelusuran BLAST (BLAST search) pada basis data sekuens memungkinkan ilmuwan untuk mencari sekuens asam nukleat maupun protein yang mirip dengan sekuens tertentu yang dimilikinya. Hal ini berguna misalnya untuk menemukan gen sejenis pada beberapa organisme atau untuk memeriksa keabsahan hasil sekuensing maupun untuk memeriksa fungsi gen hasil sekuensing. Algoritma yang mendasari kerja BLAST adalah penyejajaran sekuens.

PDB (Protein Data Bank, Bank Data Protein) adalah basis data tunggal yang menyimpan model struktural tiga dimensi protein dan asam nukleat hasil penentuan eksperimental (dengan kristalografi sinar-X, spektroskopi NMR dan mikroskopi elektron). PDB menyimpan data struktur sebagai koordinat tiga dimensi yang menggambarkan posisi atom-atom dalam protein ataupun asam nukleat.

Analisis Ekspresi Gen

Ekspresi gen dapat ditentukan dengan mengukur kadar mRNA dengan berbagai macam teknik (misalnya dengan microarray ataupun Serial Analysis of Gene Expression ["Analisis Serial Ekspresi Gen", SAGE]). Teknik-teknik tersebut umumnya diterapkan pada analisis ekspresi gen skala besar yang mengukur ekspresi banyak gen (bahkan genom) dan menghasilkan data skala besar. Metode-metode penggalian data (data mining) diterapkan pada data tersebut untuk memperoleh pola-pola informatif. Sebagai contoh, metode-metode komparasi digunakan untuk membandingkan ekspresi di antara gen-gen, sementara metode-metode klastering (clustering) digunakan untuk mempartisi data tersebut berdasarkan kesamaan ekspresi gen.

Sumber :

1. http://id.wikipedia.org/wiki/Bioinformatika
2. http://suryokuncorojakti-fkh.web.unair.ac.id/artikel_detail-38847-Biomolekuler%20dan%20Imunologi-Bioinformatika.html
3. http://bioinformatika-q.blogspot.com/

Proses Bisnis Dalam Sistem Informasi

Persaingan bisnis yang semakin kompetitif yang semakin lengkap dan terlebih lagi perekonomian kita sedang dilanda krisis, walaupun kenyataan seperti itu tidak menjadi suatu halangan bagi para pebisnis perusahaan tetap berfikir positif untuk melanjutkan bisnis yang menurutnya adalah yakin karena pangsa pasar di tempat kita akan semakin mencerahkan pandangan para pengusaha yang menanamkan sahamnya di Indonesia, terlebih lagi pangsa pasar yang semakin meningkat pesat perkembanganya yaitu pansa pasar perkembangan system informasi yang seakan akan kita menjual serba ada karena bukan hanya produk yang ditawarkan melainkan jasa yang yang dibuat oleh para programmer.
Masalah yang sering kali terjadi adalah perusahaan gagal atau terlambat dalam merespon tantangan bisnis yang muncul secara tidak terduga. Sebagai contoh: banyak perusahaan sangat lambat dalam mendeteksi adanya peluang-peluang bisnis baru serta dalam mendeteksi pergerakan yang dilakukan oleh kompetitor; lebih jauh lagi adalah perusahaan kadang cenderung mempunyai sifat reaktif dan tidak dapat mendeteksi masalah secara dini, dimana ini merupakan hal yang sangat kontraproduktif bagi perusahaan dalam menghadapi perkembangan bisnis di masa seperti sekarang ini.

ADAPUN SYSTEM INFORMASI YANG TERDIRI DARI:

Sistem fungsional, sistem penjualan dan pemasaran sistem manufaktur dan produksi, sistem keuangan dan akutansi serta sistem sumber daya manusia.

• Tidak ada sistem informasi tunggal faktanya, perusahaan berskala menengah dan besar memiliki ribuan program komputer dan ratusan sistem yang berbeda.

AKTIVITAS DALAM BERBISNIS ADALAH :

• Aktivitas bisnis adalah Aktiviatas kerja dari bahan baku, informasi, dan pengetahuan seperangkat aktivitas. Contohnya proses memperkerjakan karyawan.

• Aktivitas bisnis memperkerjakan dapat diuraiakan sebagai berikut:

• Membuat periklanan tempat,

• mengujungi agen pekerjaan,

• mengumpulkan surat lamaran,

• memeriksa surat lamaran,

• mewawancarai kandidat,

• mengevaluasi kandidat

• membuat keputusan kepegawaian,

• melibatkan karyawan pada sistem kepegawaian seperti penggajian, kesehatan, dan pensiun.
Sistem bisnis informasi yang terdiri dari :

• Fungsi dari system informasi ini juga meliputi system sumberdaya manusianya itu sendiri kita diharuskan mebngkaji Sdm yang ada dilingkungan kerja kita

ALUR PEMROSESAN TRANSAKSI

• Sistem pemrosesan transaksi

• Sebuah sistem pemrosesan transaksi adalah sistem terkomputerisasi yang menjalankan dan mencatat transaksi rutin harian yang diperlukan untuk menjalankan bisnis, seperti memasukkan pesanan penjualan, pemesanan hotel, penggajian, pencatatan karyawan, dan pengiriman.
• Tujuan utama dari sistem pada tingkat ini adalah untuk menjawab pertanyaan rutin dan untuk melacak arus transaksi yang melalui organisasi.

SISTEM SUMBER DAYA MANUSIA

• Fungsi sumber daya manusia bertanggung jawab untuk menarik, mengembangkan, dan mempertahankan tenaga kerja perusahaan. Sistem informasi sumber daya manusia (human resources informasion system) mendukung aktivitas seperti mengenali karyawan potensial, menjaga catatan lengkap mengenai karyawan yang ada, dan menciptakan program untuk mengembangkan bakat dan keahlian karyawan.

• Sistem sumber daya manusia membantu manajemen senior mengenali kebutuhan sumber daya manusia

SISTEM INFORMASI MANAJEMEN

• Sistem informasi manajemen-SIM (manajemen information system-MIS) juga merancang kategori khusus sistem informasi yang melayani manajemen tingkat menengah. SIM menyediakan laporan kinerja terbaru perusahaan kepada manajemen tingkat menengah. Informasi ini digunakan untuk mengawasi dan mengendalikan bisnis dan memprediksi kinerja di masa depan.

HUBUNGAN ANTAR SISTEM

• Berbagai jenis sistem dalam sebuah organisasi saling terkait satu sama lain. TPS adalah penghasil utama informasi yang dibutuhkan oleh kebanyakan sistem lain dalam perusahaan, yang selanjutnya akan menghasilkan informasi untuk sistem yang lain. Pada kebanyakan perusahaan, jenis sistem yang berbeda tersebut relatif tidak terkait. Namun demikian, semakin banyak perusahaan yang menggunakan teknologi baru untuk mengintegrasikan informasi yang berada dalam sistem yang berbeda.

SISTEM YANG MELINGKUPI PERUSAHAAN

• APLIKASI PERUSAHAAN : Aplikasi dimana untuk melakukan pemrosesan agar mempermudah pekerjaan yang kita lakukan

• Aplikasi perusahaan (enterprise application) yang merupakan sistem yang melingkupi area fungsional, berfokus pada menjalankan proses bisnis di dalam perusahaan bisnis, termasuk seluruh tingkatan manajemen. Aplikasi perusahaan membantu bisnis untuk menjadi lebih fleksibel dan produktif dengan mengoordinasikan proses bisnis dengan lebih dekat dan mengintegrasikan sekelompok proses agar mereka berfokus pada pengelolaan sumber daya yang efisien dan pelayanan pelanggan.

SISTEM MANAJEMEN HUBUNGAN PELANGGAN

Sistem manajemen hubungan pelanggan (customer relationship manajement-CRM) membantu perusahaan mengelola hubungannya dengan pelanggan. Sistem ini menyediakan informasi untuk mengordinasikan seluruh proses bisnis yang berhubungan dengan pelanggan dalam hal :

1. Penjualan

2. Pemasaran

3. Pelayanan untuk mengoptimalkan pendapatan

4. Kepuasan pelanggan

5. Mempertahankan pelanggan

E-BUSINESS,E-COMMERCE DAN E.GOVERNMENT

• E-BUSINESS => mengacu kepada penggunaan teknologi digital dan internet untuk menjalankan proses bisnis utama pada perusahaan.

• E-COMMERCE => bagian dari E-business yang berhubungan dengan pembelian dan penjualan barang dan jasa melalui internet.

• E.GOVERNMENT => mengacu kepada aplikasi internet dan teknologi jaringan untuk secara digital memungkinkan hubungan pemerintah dan agen sektor publik dengan masyarakat, bisnis, dan perpanjangan pemerintahan lainnya.

DEPARTEMEN SISTEM INFORMASI

• Departemen sistem informasi (information system departement) adalah unit organisasi formal yang bertanggung jawab untuk memelihara peranti keras, peranti lunak, penyimpan data dan jaringan yang mencakup infrastruktur teknologi informasi perusahaan.

ORGANISASI SISTEM INFORMASI :

1. Programer

yaitu spesialis teknis yang sangat terlatih yang menulis instruksi peranti lunak untuk komputer.

2. Analis sistem

merupakan pekerjaan analis sistem untuk menterjemahkan masalah dan persyaratan bisnis menjadi kebutuhan informasi dan sistem.

3. Manager sistem informasi

adalah pemimpin tim programer dan analis, manajer proyek, manajer fasilitas fisik, pengoperasi komputer dan staf yang memasukkan data.

• Mengelola fungsi sistem informasi

• Praktik Aplikasi SIM

• Menganalisis kinerja keuangan

• Memperbaiki proses pengambilan keputusan

• Menggunakan spreadsheet untuk memilih pemasok


Sumber : http://sigitbayunugroho.blogspot.com/

Business Information System

8.2.2 Penilaian Kelayakan

Penilaian kelayakan adalah aktivitas yang terjadi pada awal proyek untuk memastikan bahwa proyek tersebut adalah proposisi bisnis yang layak. Laporan kelayakan menganalisis kebutuhan dan dampak dari sistem dan mempertimbangkan berbagai alternatif untuk memperoleh perangkat lunak. Penilaian kelayakan dapat dianggap sebagai bagian dari tahap inisiasi. Ini akan menentukan apakah suatu sistem informasi berbasis komputer sesuai kriteria kelayakan tertentu. Tiga kriteria tersebut biasanya dikutip:

• Ini harus ditetapkan apakah sistem informasi secara teknis layak. Untuk secara teknis layak, baik teknologi yang ada atau dapat diciptakan untuk mendukung sistem yang diperlukan.

• Untuk layak secara ekonomis, sistem informasi harus menghasilkan lebih di jalan manfaat dari biaya yang diperlukan untuk memproduksinya. Salah satu masalah di sini adalah bahwa manfaat seringkali sulit untuk mengukur dalam istilah moneter, sedangkan biaya yang jauh lebih mudah untuk memperkirakan.

• Dengan asumsi bahwa sistem informasi yang diusulkan secara teknis dan ekonomis layak, penilaian harus terbuat dari apakah proyek secara operasional dan organisasional layak. Dengan operasional layak, kita berarti bahwa sistem harus mampu melakukan dalam parameter kecepatan, volume, kegunaan dan keandalan yang dibutuhkan. Juga, menjadi layak untuk organisasi, sistem informasi yang diusulkan baik harus mampu berjalan di samping pola kerja atau pola kerja yang ada harus mampu diadaptasi atau re-direkayasa untuk berjalan bersama sistem informasi baru. Organisasi kelayakan akan melibatkan kajian mengenai keterampilan pengguna potensial 'set dan sikap akan mempengaruhi sistem.

Bagian dari proses kelayakan mungkin undangan untuk tender untuk beberapa atau semua elemen sistem informasi. Ini mungkin termasuk perangkat lunak aplikasi, perangkat keras, teknologi komunikasi atau perangkat lunak sistem. Alternatif yang berbeda dari vendor yang berbeda maka akan dinilai. Output dari langkah ini (dan, karena itu, input ke langkah berikutnya dari model) adalah review panggung dan kelayakan laporan, yang akan merekomendasikan baik bahwa hasil proyek atau bahwa proyek ini dinilai ulang dalam beberapa cara.

8.2.3 sistem analisis

Sistem analisis adalah penangkapan kebutuhan bisnis dari sistem dari berbicara atau mengamati end-user dan menggunakan sumber informasi lain seperti dokumentasi sistem yang ada. Setelah sistem informasi yang diusulkan setuju untuk menjadi layak, maka perlu untuk melaksanakan pekerjaan rinci menilai persyaratan yang tepat bahwa pengguna dimaksudkan miliki untuk sistem baru. Perhatikan bahwa langkah analisis sistem kadang-kadang disebut sebagai langkah 'persyaratan tekad' atau langkah 'sistem studi. Ada tiga tugas utama dalam fase ini. Pertama, perlu memperoleh pemahaman tentang bagaimana sistem informasi saat ini (komputerisasi atau kertas-based) bekerja. Kedua, model diagram kerja sistem saat ini diproduksi untuk memastikan bahwa para profesional TI dan pengguna sistem berada dalam perjanjian. Akhirnya, satu set persyaratan untuk sistem informasi baru diproduksi. Spesifikasi kebutuhan akan menentukan:

• fitur bahwa sistem baru dibutuhkan untuk mengandung (misalnya kemampuan untuk end-user untuk dapat merancang laporan mereka sendiri);

• ruang lingkup dari sistem yang sedang dipertimbangkan (misalnya, adalah sistem yang dimaksudkan untuk hanya satu bidang fungsional bisnis atau itu untuk merangkul semua kegiatan usaha?);

• yang dimaksudkan pengguna sistem baru;

• kinerja sistem standar, termasuk waktu respon, waktu pemrosesan batch (jika diperlukan) dan kebutuhan keandalan;

• lingkungan persyaratan seperti lingkungan kerja fisik, sistem operasi dan perangkat keras yang sistem akan berjalan. Dalam tugas akhir ini, mungkin diinginkan untuk menghasilkan model lain diagram, kali ini dari sistem informasi yang diperlukan.

Jika pada titik tertentu dapat diketahui bahwa persyaratan sistem yang diartikulasikan oleh calon pengguna tampaknya tidak layak dalam beberapa cara, maka akan diperlukan untuk meninjau kembali langkah kelayakan dan melakukan analisis tambahan opsi yang mungkin. Output dari langkah ini dalam model akan menjadi pengguna persyaratan analisis dokumen yang rincian apa sistem yang diusulkan harus lakukan.